Cuando clono una máquina,¿Se crean los mismos archivos?

Si, solo que si la clonación no es completa y es enlazada, una nueva máquina con los mismos archivos será creada pero los archivos de las unidades de disco duro virtuales serán vinculados a los archivos de unidad de disco duro virtual de la máquina original y no podrá mover la nueva máquina virtual a un pc diferente sin mover los originales también.